Konfederācijas ģenerālis Tomass “Stonewall” Džeksons sagūstīja Harpersu prāmi, Virdžīnijā (mūsdienu Rietumvirdžīnijā) un apmēram 12 000 Savienības karavīru, kad ģenerāļa Roberta E. Lī armija pārvietojas uz ziemeļiem uz Mērilendu.
Federālais garnizons Harpers Ferry iekšpusē bija jutīgs pret konfederāciju uzbrukumu pēc Lī iebrukuma Merilendā septembrī. Stratēģiskā pilsēta pie Potomakas upes tika atdalīta no pārējās Savienības armijas. Potomaku armijas komandieris ģenerālis Džordžs B. Makklāns nosūtīja sūtīt uz savienības ģenerāli Diksonu Milesu, Harpers prāmja garnizona komandieri, lai par katru cenu turētu pilsētu. Makklāns solīja palīdzēt, taču viņam bija jātiek galā ar pārējo konfederācijas armiju.
Džeksons savu artilēriju nofiksēja savā vietā un 14. septembrī sāka aplaupīt pilsētu. Jankiem pietrūka munīcijas, un Miless piedāvāja nelielu pretestību, pirms piekrita nodošanai 15. septembra rītā. Kad Miles palīdzība, ģenerālis Džūlijs Vaits, devās uz Džeksons, lai vienotos par nodošanas noteikumiem, viens konfederācijas lielgabals turpināja šaut. Milesam tika ievainots pēdējais šāviens, kas tika izšauts uz Harpersas prāmi.
Yankees Harpers Ferry nodeva 73 artilērijas gabalus, 13 000 šautenes un apmēram 12 000 vīru. Tā bija lielākā vienotā kara nodošana Savienībai.
Harpers Ferry krišana pārliecināja Lī mainīt savus plānus. Pēc smagajiem zaudējumiem 14. septembrī Mērilendā pie Dienvidu kalna kaujas uz ziemeļaustrumiem no Harpersas prāmja, Lī bija iecerējis savākt izkaisīto karaspēku un atgriezties Virdžīnijā. Tagad, kad Harpers Ferry ir drošs, viņš uzaicināja Džeksonu pievienoties pārējiem spēkiem ap Šarpsburgu, Mērilendā. Divas dienas vēlāk, 17. septembrī, Lī un Makdellans cīnījās Antietamas kaujā.